Статьи

Семь баз данных за семь недель — Hbase Day 2

Март 19, 2019

Этот пост представляет собой резюме второго дня Hbase из книги « Семь баз данных за семь недель» .
Большинство команд и скриптов можно найти на GitHub: https://github.com/eyalgo/seven-dbs-in-seven-weeks/tree/master/hbase/day_2

Потоковый скрипт

Первым делом во второй день была загрузка большого количества данных (больших данных) и их передача в Hbase. Есть сценарий JRuby, который мне пришлось изменить, чтобы он работал: https://github.com/eyalgo/seven-dbs-in-seven-weeks/blob/master/hbase/day_2/import_from_wikipedia.rb

После ее изменения, как было предложено в книге, мне пришлось добавить некоторое сжатие в семейство столбцов. После этого я мог запустить скрипт:

1
2
3
curl http://dumps.wikimedia.org/enwiki/latest/enwiki-latest-pages-articles.xml.bz2 | bzcat | /opt/hbase/hbase-0.94.18/bin/hbase shell /home/eyalgo/seven-dbs-in-seven-weeks/hbase/day_2/import_from_wikipedia.rb
 
curl http://dumps.wikimedia.org/enwiktionary/latest/enwiktionary-latest-pages-articles.xml.bz2 | bzcat | /opt/hbase/hbase-0.94.18/bin/hbase shell import_from_wikipedia.rb

Это вывод при запуске скрипта

1
2
3
4
1 10.0G    1  128M    0     0   456k      0  6:23:37  0:04:48  6:18:49  817k19000 records inserted (Serotonin)
  1 10.0G    1  131M    0     0   461k      0  6:19:03  0:04:51  6:14:12  921k19500 records inserted (Serotonin specific reuptake inhibitors)
  1 10.0G    1  135M    0     0   469k      0  6:12:45  0:04:54  6:07:51 1109k20000 records inserted (Tennis court)
  1 10.0G    1  138M    0     0   477k      0  6:06:12  0:04:57  6:01:15 1269k20500 records inserted (Tape drive)

Следующая часть этой главы рассказывает о регионах и некоторых других сантехнических работах.

Построить таблицу ссылок

В этой части источником является большая вики-таблица, а выходом — таблица ссылок. Каждая ссылка имеет «От:» и «Кому:». Вот ссылка на измененный рабочий скрипт: https://github.com/eyalgo/seven-dbs-in-seven-weeks/blob/master/hbase/day_2/generate_wiki_links.rb

В оставшейся части главы показано, как смотреть на данные, считать их и многое другое.

Домашнее задание

Основная часть домашней работы заключалась в создании новой таблицы: «продукты», которая берет данные из XML, который можно загрузить с сайта здравоохранения и питания США. Эти данные показывают факты питания для каждого типа пищи.

Я решил создать очень простую таблицу. Семейство столбцов не имеет специальных параметров. Я создал одно семейство столбцов: факты . Каждая строка данных из файла XML будет частью фактов. Я также решил, что ключом строки будет Display_Name . В конце концов, гораздо проще смотреть по ключу, а не по идентификатору.

1
create 'foods' , 'facts'

Чтобы увидеть, как я должен создать скрипт, я посмотрел на два источника:

  1. Скрипт, который импортировал данные для таблицы Wiki
  2. Один элемент (еда) из XML

Вот один элемент:

01
02
03
04
05
06
07
08
09
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
<Food_Display_Row>
  <Food_Code>12350000</Food_Code>
  <Display_Name>Sour cream dip</Display_Name>
  <Portion_Default>1.00000</Portion_Default>
  <Portion_Amount>.25000</Portion_Amount>
  <Portion_Display_Name>cup </Portion_Display_Name>
  <Factor>.25000</Factor>
  <Increment>.25000</Increment>
  <Multiplier>1.00000</Multiplier>
  <Grains>.04799</Grains>
  <Whole_Grains>.00000</Whole_Grains>
  <Vegetables>.04070</Vegetables>
  <Orange_Vegetables>.00000</Orange_Vegetables>
  <Drkgreen_Vegetables>.00000</Drkgreen_Vegetables>
  <Starchy_vegetables>.00000</Starchy_vegetables>
  <Other_Vegetables>.04070</Other_Vegetables>
  <Fruits>.00000</Fruits>
  <Milk>.00000</Milk>
  <Meats>.00000</Meats>
  <Soy>.00000</Soy>
  <Drybeans_Peas>.00000</Drybeans_Peas>
  <Oils>.00000</Oils>
  <Solid_Fats>105.64850</Solid_Fats>
  <Added_Sugars>1.57001</Added_Sugars>
  <Alcohol>.00000</Alcohol>
  <Calories>133.65000</Calories>
  <Saturated_Fats>7.36898</Saturated_Fats>
</Food_Display_Row>

Я создал сценарий, изучив сценарий вики и один элемент. Открытие документа происходит при обнаружении открытого тега элемента XML: Food_Display_Row . Видя Food_Display_Row как закрывающий тег, скрипт создает документ.

01
02
03
04
05
06
07
08
09
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
include Java
import 'org.apache.hadoop.hbase.client.HTable'
import 'org.apache.hadoop.hbase.client.Put'
import 'org.apache.hadoop.hbase.HBaseConfiguration'
import 'javax.xml.stream.XMLStreamConstants'
 
def jbytes( *args )
  args.map { |arg| arg.to_s.to_java_bytes }
end
 
factory = javax.xml.stream.XMLInputFactory.newInstance
reader = factory.createXMLStreamReader(java.lang.System.in)
 
document = nil
buffer = nil
count = 0
 
puts( @hbase )
conf = HBaseConfiguration.new
table = HTable.new( conf, "foods" )
table.setAutoFlush( false )
 
while reader.has_next
  type = reader.next
   
  if type == XMLStreamConstants::START_ELEMENT # (3)
   
    case reader.local_name
    when 'Food_Display_Row' then document = {}
    when /Display_Name|Portion_Default|Portion_Amount|Portion_Display_Name|Factor/ then buffer = []
    when /Increment|Multiplier|Grains|Whole_Grains|Vegetables|Orange_Vegetables/ then buffer = []
    when /Drkgreen_Vegetables|Starchy_vegetables|Other_Vegetables|Fruits|Milk|Meats/ then buffer = []
    when /Drybeans_Peas|Soy|Oils|Solid_Fats|Added_Sugars|Alcohol|Calories|Saturated_Fats/ then buffer = []
    end
     
  elsif type == XMLStreamConstants::CHARACTERS
    buffer << reader.text unless buffer.nil?
     
  elsif type == XMLStreamConstants::END_ELEMENT
     
    case reader.local_name
    when /Display_Name|Portion_Default|Portion_Amount|Portion_Display_Name|Factor/
      document[reader.local_name] = buffer.join
    when /Increment|Multiplier|Grains|Whole_Grains|Vegetables|Orange_Vegetables/
      document[reader.local_name] = buffer.join
    when /Drkgreen_Vegetables|Starchy_vegetables|Other_Vegetables|Fruits|Milk|Meats/
      document[reader.local_name] = buffer.join
    when /Drybeans_Peas|Soy|Oils|Solid_Fats|Added_Sugars|Alcohol|Calories|Saturated_Fats/
      document[reader.local_name] = buffer.join
 
    when 'Food_Display_Row'
      key = document['Display_Name'].to_java_bytes
       
      p = Put.new( key )
      p.add( *jbytes( "facts", "Display_Name", document['Display_Name'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Portion_Default", document['Portion_Default'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Portion_Amount", document['Portion_Amount'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Portion_Display_Name", document['Portion_Display_Name'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Factor", document['Factor'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Increment", document['Increment'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Multiplier", document['Multiplier'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Grains", document['Grains'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Whole_Grains", document['Whole_Grains'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Vegetables", document['Vegetables'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Orange_Vegetables", document['Orange_Vegetables'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Drkgreen_Vegetables", document['Drkgreen_Vegetables'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Starchy_vegetables", document['Starchy_vegetables'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Other_Vegetables", document['Other_Vegetables'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Fruits", document['Fruits'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Milk", document['Milk'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Meats", document['Meats'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Drybeans_Peas", document['Drybeans_Peas'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Soy", document['Soy'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Oils", document['Oils'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Solid_Fats", document['Solid_Fats'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Added_Sugars", document['Added_Sugars'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Alcohol", document['Alcohol'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Calories", document['Calories'] ) )
      p.add( *jbytes( "facts", "Saturated_Fats", document['Saturated_Fats'] ) )
 
      table.put( p )
       
      count += 1
      table.flushCommits() if count % 10 == 0
      if count % 500 == 0
        puts "#{count} records inserted (#{document['Display_Name']})"
      end
    end
  end
end
 
table.flushCommits()
exit

Ниже приведены команды оболочки, которые берут файл XML и передают его в Hbase. Первая команда запускается для файла с одним элементом. После проверки правильности я запустил его до полного файла.

1
2
3
curl file:///home/eyalgo/seven-dbs-in-seven-weeks/hbase/day_2/food-display-example.xml | cat | /opt/hbase/hbase-0.94.18/bin/hbase shell /home/eyalgo/seven-dbs-in-seven-weeks/hbase/day_2/import_food_display.rb
 
curl file:///home/eyalgo/seven-dbs-in-seven-weeks/hbase/day_2/MyFoodapediaData/Food_Display_Table.xml | cat | /opt/hbase/hbase-0.94.18/bin/hbase shell /home/eyalgo/seven-dbs-in-seven-weeks/hbase/day_2/import_food_display.rb

Давайте немного еды …

1
get 'foods' , 'fruit smoothie made with milk'

И результат:

01
02
03
04
05
06
07
08
09
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
COLUMN CELL
facts:Added_Sugars timestamp=1399932481440, value=82.54236
facts:Alcohol timestamp=1399932481440, value=.00000
facts:Calories timestamp=1399932481440, value=197.96000
facts:Display_Name timestamp=1399932481440, value=fruit smoothie made with milk
facts:Drkgreen_Vegetables timestamp=1399932481440, value=.00000
facts:Drybeans_Peas timestamp=1399932481440, value=.00000
facts:Factor timestamp=1399932481440, value=1.00000
facts:Fruits timestamp=1399932481440, value=.56358
facts:Grains timestamp=1399932481440, value=.00000
facts:Increment timestamp=1399932481440, value=.25000
facts:Meats timestamp=1399932481440, value=.00000
facts:Milk timestamp=1399932481440, value=.22624
facts:Multiplier timestamp=1399932481440, value=.25000
facts:Oils timestamp=1399932481440, value=.00808
facts:Orange_Vegetables timestamp=1399932481440, value=.00000
facts:Other_Vegetables timestamp=1399932481440, value=.00000
facts:Portion_Amount timestamp=1399932481440, value=1.00000
facts:Portion_Default timestamp=1399932481440, value=2.00000
facts:Portion_Display_Name timestamp=1399932481440, value=cup
facts:Saturated_Fats timestamp=1399932481440, value=1.91092
facts:Solid_Fats timestamp=1399932481440, value=24.14304
facts:Soy timestamp=1399932481440, value=.00000
facts:Starchy_vegetables timestamp=1399932481440, value=.00000
facts:Vegetables timestamp=1399932481440, value=.00000
facts:Whole_Grains timestamp=1399932481440, value=.00000
Ссылка: Семь баз данных за семь недель — Hbase Day 2 от нашего партнера по JCG Эяля Голана в блоге « Обучение и совершенствование в качестве мастера» .
36
Share: