В этом разделе объясняется, как установить Biopython на ваш компьютер. Он очень прост в установке и займет не более пяти минут.
Шаг 1 — Проверка установки Python
Biopython предназначен для работы с Python 2.5 или более поздними версиями. Таким образом, обязательно, чтобы Python был установлен первым. Запустите приведенную ниже команду в командной строке —
> python --version
Это определено ниже —
Он показывает версию Python, если установлен правильно. В противном случае загрузите последнюю версию python, установите его и затем снова введите команду.
Шаг 2 — Установка Biopython с помощью pip
Biopython легко установить с помощью pip из командной строки на всех платформах. Введите следующую команду —
> pip install biopython
Следующий ответ будет виден на вашем экране —
Для обновления старой версии Biopython —
> pip install biopython –-upgrade
Следующий ответ будет виден на вашем экране —
После выполнения этой команды более старые версии Biopython и NumPy (от этого зависит Biopython) будут удалены перед установкой последних версий.
Шаг 3 — Проверка установки Biopython
Теперь вы успешно установили Biopython на свой компьютер. Чтобы убедиться, что Biopython установлен правильно, введите следующую команду на консоли python:
Показывает версию Biopython.
Альтернативный способ — установка Biopython с использованием Source
Чтобы установить Biopython с использованием исходного кода, следуйте приведенным ниже инструкциям —
Загрузите последний выпуск Biopython по следующей ссылке — https://biopython.org/wiki/Download
На данный момент последней версией является biopython-1.72 .
Загрузите файл и распакуйте сжатый архивный файл, перейдите в папку с исходным кодом и введите следующую команду —
> python setup.py build
Это создаст Biopython из исходного кода, как указано ниже —
Теперь протестируйте код с помощью следующей команды —
> python setup.py test
Наконец, установите с помощью следующей команды —
> python setup.py install