Biopython имеет обширный тестовый скрипт для тестирования программного обеспечения в различных условиях, чтобы убедиться, что программное обеспечение не содержит ошибок. Чтобы запустить тестовый скрипт, загрузите исходный код Biopython, а затем выполните следующую команду:
python run_tests.py
Это запустит все тестовые сценарии и даст следующий результат:
Python version: 2.7.12 (v2.7.12:d33e0cf91556, Jun 26 2016, 12:10:39) [GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] Operating system: posix darwin test_Ace ... ok test_Affy ... ok test_AlignIO ... ok test_AlignIO_ClustalIO ... ok test_AlignIO_EmbossIO ... ok test_AlignIO_FastaIO ... ok test_AlignIO_MauveIO ... ok test_AlignIO_PhylipIO ... ok test_AlignIO_convert ... ok ........................................... ...........................................
Мы также можем запустить отдельный тестовый скрипт, как указано ниже —
python test_AlignIO.py
Заключение
Как мы узнали, Biopython является одним из важных программ в области биоинформатики. Будучи написанным на python (легко учиться и писать), он предоставляет широкие функциональные возможности для любых вычислений и операций в области биоинформатики. Он также обеспечивает простой и гибкий интерфейс практически со всем популярным программным обеспечением для биоинформатики, чтобы использовать его функциональность.