Учебники

Python Pandas — разреженные данные

Разреженные объекты «сжимаются», когда любые данные, соответствующие определенному значению (NaN / отсутствующее значение, хотя любое значение может быть выбрано), опущены. Специальный объект SparseIndex отслеживает, где данные были «очищены». Это будет иметь гораздо больше смысла в примере. Все стандартные структуры данных Pandas применяют метод to_sparse

Live Demo

import pandas as pd
import numpy as np

ts = pd.Series(np.random.randn(10))
ts[2:-2] = np.nan
sts = ts.to_sparse()
print sts

Его вывод выглядит следующим образом —

0   -0.810497
1   -1.419954
2         NaN
3         NaN
4         NaN
5         NaN
6         NaN
7         NaN
8    0.439240
9   -1.095910
dtype: float64
BlockIndex
Block locations: array([0, 8], dtype=int32)
Block lengths: array([2, 2], dtype=int32)

Разреженные объекты существуют по соображениям эффективности памяти.

Давайте теперь предположим, что у вас был большой DataFrame NA, и выполните следующий код:

Live Demo

import pandas as pd
import numpy as np

df = pd.DataFrame(np.random.randn(10000, 4))
df.ix[:9998] = np.nan
sdf = df.to_sparse()

print sdf.density

Его вывод выглядит следующим образом —

0.0001

Любой разреженный объект можно преобразовать обратно в стандартную плотную форму, вызвав to_dense

Live Demo

import pandas as pd
import numpy as np
ts = pd.Series(np.random.randn(10))
ts[2:-2] = np.nan
sts = ts.to_sparse()
print sts.to_dense()

Его вывод выглядит следующим образом —

0   -0.810497
1   -1.419954
2         NaN
3         NaN
4         NaN
5         NaN
6         NaN
7         NaN
8    0.439240
9   -1.095910
dtype: float64

Разреженные Dtypes

Разреженные данные должны иметь тот же тип d, что и их плотное представление. В настоящее время поддерживаются float64, int64 и booldtypes . В зависимости от исходного dtype, значение fill_value по умолчанию меняется —

  • float64 — np.nan

  • int64 — 0

  • bool — False

float64 — np.nan

int64 — 0

bool — False

Давайте выполним следующий код, чтобы понять то же самое —

Live Demo

import pandas as pd
import numpy as np

s = pd.Series([1, np.nan, np.nan])
print s

s.to_sparse()
print s

Его вывод выглядит следующим образом —